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唐雅茹1,國立東1,2,王娜娜1,霍責成1*
1.東北農(nóng)業(yè)大學乳品科學教育部重點實驗室(哈爾濱150030);2.黑龍江中醫(yī)藥大學藥學院(哈爾濱150030)
摘要對初步篩選得到的膽酸鹽水解酶活性高的2株乳桿菌進行了16S rDNA鑒定,結(jié)果表明,KLDS l.0317和KLDS l.0386均為植物乳桿菌。以;敲撗跄懰猁}和甘氨脫氧膽酸鹽為底物,對兩株植物乳桿菌所產(chǎn)BSH的比酶活進行了測定,試驗證明了BSH具有底物特異性,且兩株菌降解甘氨結(jié)合膽鹽的能力強于;墙Y(jié)合膽鹽;利用PCR技術(shù)克隆出膽酸鹽水解酶基因,翻譯成相應的氨基酸,并利用生物分析手段對bsh 1基因以及其預測氨基酸序列進行了對比分析,結(jié)果表明,兩株植物乳桿菌的bsh 1基因非常保守,且預測的氨基酸序列的相似性非常高,不低于98%。
關(guān)鍵詞植物乳桿菌;膽鹽水解酶基因:16S rDNA;酶活
隨著人們生活水平的不斷提高,高血壓、糖尿病和冠心病等各種心血管疾病已經(jīng)成為了人群高發(fā)病,世界衛(wèi)生組織預測在未來的10年里,高膽固醇所引起的疾病將位居所有疾病死亡的人數(shù)之首。乳酸菌在食品生產(chǎn)中的應用具有悠久的歷史,被認為是安全可靠的益生菌。早在1977年.Mann和Spoerry[4]發(fā)現(xiàn)長期飲用乳制品的非洲Masai人的膽固醇水平明顯低于普通人。這一發(fā)現(xiàn)受到了廣泛的關(guān)注,并對研究乳酸菌降膽固醇功能起到了帶頭作用。DE smet指出乳酸菌能夠降低膽固醇與乳酸菌產(chǎn)的膽鹽水解酶有密切相關(guān)。
膽鹽水解酶( Bile salt hydrolase,BSH)是微生物生長、繁殖過程中產(chǎn)生的一種代謝產(chǎn)物。該酶是bsh基因編碼的一種胞內(nèi)酶,對氧氣不敏感,適宜在微酸性環(huán)境下生長,能水解胃腸道中的結(jié)合態(tài)膽鹽(;悄懰猁}和甘氨膽酸鹽),將其轉(zhuǎn)變生成氨基酸和非結(jié)合態(tài)膽酸,從而使血清中膽固醇含量降低。植物乳桿菌中同時存在4個bsh基因,分別命名為bsh l~bsh
4,bsh 1比其他3種bsh表現(xiàn)出更高的降解膽鹽能力。通過對bsh基因組學方面的研究,讓人們對BSH的功能有了進一步的認識。
對初步篩選得到的產(chǎn)膽酸鹽水解酶的2株乳酸菌進行16S rDNA鑒定;并對兩株菌所產(chǎn)BSH的活性進行了初步研究;利用PCR技術(shù)克隆出了編碼BSH相應的基因片段,并進行了對比分析。為乳酸菌在降膽固醇方面的研究提供參考依據(jù)。
1材料與方法
1.1材料
植物乳桿菌KLDS l.0317、植物乳桿菌KLDS1.0386,教育部乳品重點實驗室保存。
1.2主要試劑與儀器
;撬帷⒏拾彼、甘氨脫氧膽酸鹽、;敲撗跄懰猁}:Sigma公司;水和茚三酮、牛血清白蛋白、考馬斯亮藍:天津基準化學試劑有限公司;試驗用水為蒸餾水。
低溫冷凍離心機:上海市離心機械研究所;超聲破碎粉碎機:SCIENTZ公司;Biometra Tperson PCR儀:德國Biometra公司;紫外一可見分光光度計、厭氧箱:THERMO ELECERON CORPORATION公司。
1.3試驗方法
1.3.1 菌種16S rDNA鑒定
將試驗菌株KLDS l.0317和KLDS l.0386在MRS液體培養(yǎng)基中傳代培養(yǎng)。利用細菌基因組DNA提取試劑盒提取2株菌的總DNA。以所提總DNA為模板,通用引物27F( AGAGTTTGATCCTGGCTCA),1492R( TACGGCTACCTTGTTACGACTT)進行PCR克隆。反應條件:95 ℃預變性4 min;94℃變性1 min,58℃退火1 min,72℃延伸2 min,30個循環(huán);72℃延
伸7 min。PCR產(chǎn)物利用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,并用凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果。送由華大科技公司測序。測序結(jié)果同NCBI數(shù)據(jù)庫中的相關(guān)菌株構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.3.2膽酸鹽水解酶活力的測定
將菌株KLDS l.0317和KLDS l.0386在MRS固體培養(yǎng)基上劃線,37℃厭氧箱中培養(yǎng)24 h,挑取單菌落接種于MRS液體培養(yǎng)基中,活化兩代后,培養(yǎng)15 h至平臺初期。配制20 mg/L的牛磺酸(;撬幔藴嗜芤,分別稀釋成質(zhì)量濃度為0,4,8,12,16和20 mg/L的溶液,取稀釋液2 m L于試管中,加1 m L茚三酮顯色液,漩渦震蕩混勻,沸水浴15 min,冷卻后加1 m L95%乙醇,充分混勻,測570 nm處吸光度。以;撬幔ǜ拾彼幔┵|(zhì)量濃度為橫坐標,吸光度為縱坐標繪制標準曲線。BSH酶活測定方法。
1.3.3蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度的測定
稱量1g牛血清白蛋白,溶解并定容到1L,配成1 g/L的標準溶液。稀釋成質(zhì)量濃度為0,0.05,0.1,0.15,0.2,0.25,0.3和0.35 g/L,分別吸取300μ L各濃度標準溶液和粗酶液至干凈試管,加入3 m L蛋白質(zhì)顯色液,充分混勻,常溫放置2 min后迅速測量在595 nm波長下的吸光度。
1.3.4 bsh 1引物設(shè)計及合成
從NCBI數(shù)據(jù)庫獲得多個植物乳桿菌膽酸鹽水解酶
基因序列,用Primer premier 6.0軟件設(shè)計bsh 1引物,
1.3.5bsh 1基因的克隆及檢測
提取菌株的總基因組為模板,用合成的bsh 1引物進行PCR,反應條件:95℃預變性5 min;95℃變性30 s.46℃退火30 s.72℃延伸90 s,35次循環(huán);72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳進行檢測,后送由華大科技公司測序。
1.3.6bsh 1基因同源性分析
用Primer premier 6.0軟件將BSH序列翻譯成相應氨基酸,登陸NCBI數(shù)據(jù)庫,通過Blast比對蛋白質(zhì)相似性;利用HMMER功能鑒定保守域;并用Vector NTI 10進行蛋白同源性比對,分析BSH氨基酸序列之間的關(guān)系。
2結(jié)果與分析
2.1 菌種16S rDNA鑒定結(jié)果
將乳桿菌KLDS l.0317和KLDS l.0386的16S rDNA的測序結(jié)果提交到GENBANK,進行BLAST比對,結(jié)果表明,KLDS l.0317和KLDS l.0386與已發(fā)表的植物乳桿菌16S rDNA同源性為100%,說明這兩株菌為植物乳桿菌,圖1為2株菌的16S rDNA系統(tǒng)進化樹。
2.2甘氨酸、;撬針藴是
如圖2~圖3所示,甘氨酸標準曲線方程為:y=0.042 8x+0.000 7,R2=0.999 4;;撬針藴是方程為:y=0.022x-0.001 2,R2=0.998;都有良好的線性相關(guān)性,可用于酶活測定。
2.3 比酶活測定結(jié)果
比酶活定義為每毫克蛋白質(zhì)所含膽酸鹽水解酶的單位(U)數(shù),計算公式為式(1)。
2株乳桿菌KLDS l.0317和KLDS l.0386的比酶活測定結(jié)果如表1所示,都具有膽酸鹽水解酶活性,而且都能降解;敲撗跄懰猁}和甘氨脫氧膽酸鹽,但在甘氨脫氧膽酸鹽中的水解能力更強,說明膽鹽水解酶的水解能力與氨基酸側(cè)鏈基團有密切關(guān)系。其中,KLDS 1.0386的比酶活明顯高于KLDS 1.0317。
2.4膽酸鹽水解酶保守區(qū)的比對
N-末端親核水解酶家族在自然界廣泛分布,這些酶的共同特征是N端都有一個半胱氨酸殘基,酶被水解后,半胱氨酸即成為活性位點。BSH序列用Primerpremier 6.0軟件翻譯成相應蛋白,在NCBI上對BSH序列進行保守區(qū)序列比對,結(jié)果如圖4所示,BSH屬于N-末端親核水解酶家族,其中半胱氨酸(Cys-1)的位點是十分保守的。
2.5 BSH氨基酸序列相似性分析
近年來,研究植物乳桿菌中BSH的居多,例如植物乳桿菌L.plantarum RK21、植物乳桿菌L.plantarumMBUL91、植物乳桿菌L-plantarum Lp-onlly和植物乳桿菌L.plantarum NCDC201等。通過Primer premier 5.0軟件翻譯成氨基酸序列進行比較,結(jié)果如表2所示。植物乳桿菌的BSH氨基酸序列相似性非常高,都在98%以上。
2.6 BSH氨基酸保守性分析
利用軟件Vector NTI 10對植物乳桿菌KLDS l.0317和KLDS l.0386以及NCBI數(shù)據(jù)庫中的植物乳桿菌P-8、植物乳桿菌WCFS 1和植物乳桿菌ST-III進行BSH保守性分析。橙色顯示部分為5株菌共有的氨基酸序列,藍色顯示為部分擁有?梢钥闯5株菌保守性都較高,在70 b p以后的堿基序列部分2株菌與數(shù)據(jù)庫已知的bsh 1序列相似性極高。
3結(jié)論與討論
11試驗采用bsh 1基因特異性引物對植物乳桿菌KLDS 1.0317和KLDS l.0386進行了PCR擴增,測序結(jié)果與NCBI上已發(fā)表的膽鹽水解酶基因(EU822811)同源性為99%,故確認該2株菌含有膽鹽水解酶基因,并對膽酸鹽水解酶的核苷酸序列進行了分析。結(jié)果可知,膽酸鹽水解酶序列十分保守;將核苷酸序列翻譯成氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)植物乳桿菌KLDS 1.0317和KLDS 1.0386與植物乳桿菌RK21、植物乳桿菌MBUL91、植物乳桿菌Lp-onlly和植物乳桿菌NCDC 201的氨基酸相似度都很高,不低于98%;其氨基酸序列的保守性也很高。
21試驗通過茚三酮比色法定量測得了2株植物乳桿菌的膽酸鹽水解酶的比酶活,在兩種底物下測得的酶活有差異。Begley和Gahan等提出,細菌的膽酸鹽水解酶既能識別固醇側(cè)鏈,又能識別氨基酸側(cè)鏈,因此由結(jié)果可知,植物乳桿菌KLDS l.0317和KLDS1.0386能夠識別氨基酸側(cè)鏈,并且水解甘氨脫氧膽酸鹽的能力強于;敲撗跄懰猁},與Maire等研究表
明,大部分膽鹽水解酶對底物的水解效率是;撬岬陀诟拾彼岬氖聦嵪喾
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